Boca Juniors pelaa sinisessä paidassa, jossa on keltainen vaakaraita. Väreihin liittyvät lempinimi ”Xeneize” ja ilmaus ”azul y oro” (sininen ja kulta). Seuran tunnetuimman tarinan mukaan värit tulevat ruotsalaisen laivan lipusta, kun laiva saapui La Bocan satamaan. HEX-koodit ovat yleisiä likiarvoja, eivät seuran virallisia arvoja.
Nämä ovat yleisiä viitearvoja; ne voivat vaihdella lähteen, materiaalin ja näytön mukaan.